אוכלוסיית החרדונים המצויים בישראל מתחלקת לשני תת-מינים, צפוני (בצפון הארץ ומרכזה) ודרומי, השונים מעט אחד מהשני בגודלם ובמשקלם, בצבעם ובאורך אצבעות רגליהם האחוריות. בני תת-המין הדרומי גדולים יותר, צבע גופם בהיר יותר ועליו כתמים כתומים-אדומים בולטים יותר.
